درسال 1336 وزارت گمرک وقت در صدد تهیه بیمارستانی برای خدمات رسانی به کادر شاعل خود در منطقه ی خوزستان برآمد. لکن علیرغم گذشت چند سال از آغاز اجرای پروژه ، بدلیل آنکه تعدادکارکنان اداره ی گمرک در منطقه ی خوزستان از 500 نفر تجاوز نمی کرد، برای تأمین خدمات درمانی این تعداد پرسنل نظر وزارت گمرک تغییر کرد وصلاح را در قرار داد بستن با یک بیمارستان خصوصی یا دولتی دید ، پس به همین جهت برای فروش این ساختمان نیمه کاره با سازمان بیمه های اجتماعی وارد مذاکره شد.اما قبل از انعقاد قرار داد ، دانشگاه جندی شاپور اهواز بدلیل اینکه این ساختمان در زمینهای منتسب به این دانشگاه پی ریزی شده بود از اداره ی گمرک شکایت کرد ودر این کشمکش دانشگاه علوم پزشکی پیروز و ترتیب واگذاری آن داده شد.
دانشگاه فضای موجود را بصورت یک واحد آموزشی /درمانی ، در نظر گرفته و در نقشه تغییرات اساسی داده وآن را اجرا نمود . اما متأسفانه تغییرات سریع در کادر مدیریت و اعمال نظرات گوناگون در روند ادامه ی ساخت واجرای نقشه ، 13 سال کار را به تعویق انداخت وبودجه هنگفتی را مصروف خود گرداند.
پس از طی حدود 13 سال کار وتلاش مداوم وتنوع آراء وعقاید در مدیران ، بالأخره در تاریخ دوازدهم شهریور 1349 افتتاخ پروژه به مدیریت وقت دانشگاه علوم پزشکی محول گردید. اما باز هم این امر محقق نشد چرا که در آن زمان بیمارستان گلستان به ساختمان متروکه مبدل گشته بود که تجهیزات ولوله کشی های داخل آن پوسیده شده بود وبعلت جاری شدن سیل در ساختمان بسیاری از تأسیسات آن از بین رفتهبود . بالأخره پس از 45 روز جدیت وکار مداوم ،در مورخ 27مهر 1349 بصورت آزمایشی اولین بیمار در بخش پذیرفته شد واز آن زمان تا به امروز تلاش این مرکز در امر خدمت رسانی به مراجعین محترم و همچنین به موازات آن آموزش کادر پزشکی ودرمانی ادامه دارد.لازم به ذکر است این مرکز هم اکنون به استثناء گروه های گوش وحلق وبینی ، چشم ، زنان وزایمان ودندانپزشکی ، از سایر رشته های درمانی اعم از عمومی ، تخصصی وفوق تخصصی بهره می جوید . قابل توجه است که بخش های بسیار مهم پاراکلینیکی وفوق تخصصی همچون رادیوتراپی ، طب هسته ای ،MRI ، جراحی قلب ، شتابدهنده خطی وپیوند کلیه نیز در این مرکز فعالیت مستمر وچشمگیر دارند.